Współzależność między niedoborem żelaza a zaburzeniami przewodu pokarmowego znana jest od dawna. Dalsze tego typu spostrzeżenia wykazały, że przyczyną achlorhydril jest atrofia błony śluzowej żołądka, której często towarzyszy przewlekły stan zapalny. Badania prowadzone współcześnie wykazay , że w następstwie ciężkich niedokrwistości z niedoboru żelaza dochodzi również do uszkodzenia ściany jelita cienkiego z następowymi zaburzeniami wchłaniania. W dużej grupie chorych dorosłych z niedokrwistością niedobarwliwą zaburzenia wchłaniania D-ksylozy, a w przypadku zaawansowanej niedokrwistości z niedoboru żelaza u niemowląt prócz zmniejszenia lub braku wolnego kwasu solnego w żołądku — upośledzenk wchłaniania D-ksylozy i witaminy A. W części przypadków obserwowano również zwiększone wydalanie tłuszczów w stolcach. Opisane wyżej zmiany cofają się po uzupełnieniu rezerw żelaza. Nierzadko też u niemowląt z syderopenią wykrywano w surowicy krwi przeciwciała przeciwko białkom mleka). Zjawiska te uważane są za wtórne za zwiększoną przepuszczalnością jelit.